J'ai peut être une solution, mais ce n'est peut etre pas la plus rapide...

-Fait ton animation sur un fond bien distinct de ton logo (fond vert par exemple)
-Créer ta séquence d'image au format . bmp ou autre (décompose ton animation)
-Utilise Image Ready pour faire ton gif en précisant que le fond (vert) sera considéré comme transparent.
A toi de voir
